Das offizielle Siegel des Großmeisters zeigt eine Kuppel über einem auf Säulen ruhenden Rundbau. Allerdings ist man sich nicht einig, ob damit der templum Domini oder die Grabeskirche - beides sind Zentralbauten - dargestellt wird. In jedem Fall wurde damit auf die Anfänge des Ordens Bezug genommen. Der Tempelbezirk war die erste Niederlassung und bis 1187 der Hauptsitz der Großmeister. Sollte hingegen auf dem Siegel das Heilige Grab abgebildet sein, wird damit die ursprüngliche Aufgabe - der Schutz der Heiligen Stätten - symbolisch wiedergegeben.
Bertrand von Blanquefort, der 6. Großmeister, benutzte als erster dieses Siegel. Es wurde dann von seinen Nachfolgern